Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarb2O35114 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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