Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih2O35089 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms