Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ArxO35085 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ArxO35085 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ArxO35085 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ArxO35085 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ArxO35085 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ArxO35085 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ArxO35085 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ArxO35085 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ArxO35085 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms