Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn4O35054 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms