Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mesp2O08574 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp2O08574 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms