Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sec22bO08547 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sec22bO08547 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms