Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna4O08542 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna4O08542 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna4O08542 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms