Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IfnabL7MTU6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IfnabL7MTU6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms