Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2056J3QQ02 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2056J3QQ02 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms