Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm8356J3QPD3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8356J3QPD3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms