Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3099J3QPA5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3099J3QPA5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms