Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm21900J3QP38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21900J3QP38 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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