Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam240aJ3QNP9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam240aJ3QNP9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms