Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20918J3QN17 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20918J3QN17 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms