Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21746J3QMM6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21746J3QMM6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms