Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lipo1J3QME6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lipo1J3QME6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms