Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21818J3KMS6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21818J3KMS6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms