Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Taf4bG5E8Z2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Taf4bG5E8Z2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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