Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r12G5E8G1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r12G5E8G1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms