Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r34G3XA52 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r34G3XA52 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r34G3XA52 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r34G3XA52 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r34G3XA52 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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