Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r58G3X9U3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms