Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfgef1G3X9K3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfgef1G3X9K3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms