Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms