Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28048F7BCN0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms