Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10563F6WIE4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10563F6WIE4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms