Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn2r40F6W043 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn2r40F6W043 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms