Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933403O08RikF6UK53 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933403O08RikF6UK53 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms