Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Plekhg1F6S200 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Plekhg1F6S200 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms