Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r152E9Q9N3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r152E9Q9N3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms