Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc146E9Q9F7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms