Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms