Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms