Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930579F01RikE9Q3L6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms