Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Susd1E9Q3H4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms