Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430401F13RikE9Q328 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430401F13RikE9Q328 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms