Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Zfp558E9Q1J0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zfp558E9Q1J0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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