Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r68E9Q0V3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms