Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms