Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930426L09RikE9Q0N7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930426L09RikE9Q0N7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms