Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt78E9Q0F0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms