Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx60E9PZQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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