Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptbn4E9PX29 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sptbn4E9PX29 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms