Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsf1E9PWW9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rsf1E9PWW9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rsf1E9PWW9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms