Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ttc17E9PVB5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms