Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms