Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptrhd1D3Z4S3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms