Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms