Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smok3bC0HKC9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms