Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clip3B9EHT4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms