Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700006A11RikB9EHI3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700006A11RikB9EHI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700006A11RikB9EHI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms